Les travaux de creusement de ces accès maritimes consisteront essentiellement à araser les points hauts du chenal. Parmi les étapes importantes figure la nouvelle zone d'évitage aménagée au niveau d'Hautot sur Seine : conçue en 1987, elle devient trop étroite et ne permet pas aux navires de nouvelle génération de faire demi-tour. "Aujourd'hui, ces navires doivent rebrousser chemin [...] à hauteur de la commune de Canteleu , ce qui conduit à des escales supplémentaires et des gènes pour l'exploitation des navires déjà à quai dans le port" lisait-on dans Paris-Normandie (éd. 20décembre 2011). La première tranche de travaux démarrera en janvier 2012 entre l'embouchure de la Seine et Port Jérôme : dès juin 2012, les navires d'un tirant d'eau de 11,70 m pourront naviguer sur cette partie du fleuve.

Au total, 17% de la surface du fleuve seront dragués entre Tancarville et Rouen, et 10% en aval de Tancarville. Côté environemental, le port de Rouen a prévu le stockage et la valorisation des sédiments ainsi générés.