L’onde de marée s’arrête au barrage de Poses. Il s’agit d’un barrage au-dessus duquel les eaux peuvent déborder.
Une molécule d’eau parcourt la distance de Paris à Poses (160km) en 10 jours et la distance de Poses à l’Estuaire (160 km) en 45 jours.

Les stations d’épuration de la région parisienne (la principale est à Achères) déversent dans la Seine des eaux riches en azote (nitrate, ammoniaque) qui en se liant avec l’oxygène provoquent l’hypoxie (surtout l’été) et rendent l’eau de la Seine inapte à la vie des poissons.
Il est prévu une modernisation de ces stations d’épuration en 2015 avec l’espoir d’une nette amélioration.

Les micropolluants : calmiun, mercure, pcb, rejetés par les industries stagnent dans le sable et surtout dans la vase (la vase, plus fine, entraîne une retenue plus importante).
Ces polluants sont toxiques pour les organismes vivants. Cette pollution de la Seine participe avec celles de l’Escaut et du Rhin à l’eutrophisation de la Mer du Nord se traduisant par la prolifération d’algues vertes.