Le projet Port 2000 occupera une partie de la fosse nord (espace situé entre la digue sud du port du Havre et la digue nord submersible du chenal de l’Estuaire). La surface de la fosse nord sera réduite, ses courants de Marée plus forts et sa houle plus violente.

La conséquence probable de ces 3 phénomènes sera une accélération de la disparition des vasières : zones d'alimentation de poissons et d’oiseaux.